MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 plasmid pMDR-ZJ06

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017172	CGAAC	2	10	148	157	40 %	0 %	20 %	40 %	384145111
2	NC_017172	GCA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145111
3	NC_017172	CTGG	2	8	252	259	0 %	25 %	50 %	25 %	384145111
4	NC_017172	GGC	2	6	303	308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145111
5	NC_017172	TTC	2	6	316	321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145111
6	NC_017172	GGT	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145111
7	NC_017172	AGC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145112
8	NC_017172	TGG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145112
9	NC_017172	GCG	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145112
10	NC_017172	CG	3	6	716	721	0 %	0 %	50 %	50 %	384145112
11	NC_017172	GCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145112
12	NC_017172	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145113
13	NC_017172	GGCCT	2	10	971	980	0 %	20 %	40 %	40 %	384145113
14	NC_017172	TGG	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145113
15	NC_017172	GTT	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145113
16	NC_017172	GAGCA	2	10	1160	1169	40 %	0 %	40 %	20 %	384145113
17	NC_017172	GC	3	6	1171	1176	0 %	0 %	50 %	50 %	384145113
18	NC_017172	GGCG	2	8	1184	1191	0 %	0 %	75 %	25 %	384145113
19	NC_017172	TGA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145113
20	NC_017172	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145113
21	NC_017172	GTT	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145113
22	NC_017172	ACG	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145113
23	NC_017172	GGA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145113
24	NC_017172	GA	3	6	1290	1295	50 %	0 %	50 %	0 %	384145113
25	NC_017172	CAGC	2	8	1501	1508	25 %	0 %	25 %	50 %	384145113
26	NC_017172	ATG	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145113
27	NC_017172	GAC	2	6	1956	1961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145114
28	NC_017172	TTTC	2	8	1994	2001	0 %	75 %	0 %	25 %	384145114
29	NC_017172	GCCA	2	8	2018	2025	25 %	0 %	25 %	50 %	384145114
30	NC_017172	TCA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
31	NC_017172	ATTC	2	8	2067	2074	25 %	50 %	0 %	25 %	384145114
32	NC_017172	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145114
33	NC_017172	TTC	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145114
34	NC_017172	GTG	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145114
35	NC_017172	CAT	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
36	NC_017172	CATCT	2	10	2331	2340	20 %	40 %	0 %	40 %	384145114
37	NC_017172	CAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
38	NC_017172	AAC	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145114
39	NC_017172	ATA	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145115
40	NC_017172	GGCCT	2	10	2857	2866	0 %	20 %	40 %	40 %	384145115
41	NC_017172	TGG	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145115
42	NC_017172	GTT	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145115
43	NC_017172	GAGCA	2	10	3046	3055	40 %	0 %	40 %	20 %	384145115
44	NC_017172	GC	3	6	3057	3062	0 %	0 %	50 %	50 %	384145115
45	NC_017172	GGCG	2	8	3070	3077	0 %	0 %	75 %	25 %	384145115
46	NC_017172	TGA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145115
47	NC_017172	CTT	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145115
48	NC_017172	GTT	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145115
49	NC_017172	ACG	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145115
50	NC_017172	GGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145115
51	NC_017172	GA	3	6	3176	3181	50 %	0 %	50 %	0 %	384145115
52	NC_017172	CAGC	2	8	3387	3394	25 %	0 %	25 %	50 %	384145115
53	NC_017172	ATG	2	6	3455	3460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145115
54	NC_017172	GAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145116
55	NC_017172	CAC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145116
56	NC_017172	AGA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145116
57	NC_017172	ACA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
58	NC_017172	ATTG	2	8	3842	3849	25 %	50 %	25 %	0 %	384145116
59	NC_017172	GTA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145116
60	NC_017172	TATG	2	8	3884	3891	25 %	50 %	25 %	0 %	384145116
61	NC_017172	A	6	6	3901	3906	100 %	0 %	0 %	0 %	384145116
62	NC_017172	A	6	6	3948	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	384145116
63	NC_017172	ATT	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145116
64	NC_017172	A	6	6	4068	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	384145116
65	NC_017172	AAC	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
66	NC_017172	CAA	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
67	NC_017172	CAG	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145116
68	NC_017172	TGC	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145116
69	NC_017172	A	6	6	4383	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	384145117
70	NC_017172	AT	3	6	4437	4442	50 %	50 %	0 %	0 %	384145117
71	NC_017172	A	8	8	4528	4535	100 %	0 %	0 %	0 %	384145117
72	NC_017172	TCAA	2	8	4546	4553	50 %	25 %	0 %	25 %	384145117
73	NC_017172	TCAA	2	8	4556	4563	50 %	25 %	0 %	25 %	384145117
74	NC_017172	AG	3	6	4645	4650	50 %	0 %	50 %	0 %	384145117
75	NC_017172	AATC	2	8	4653	4660	50 %	25 %	0 %	25 %	384145117
76	NC_017172	CA	3	6	4704	4709	50 %	0 %	0 %	50 %	384145117
77	NC_017172	GCACC	2	10	4773	4782	20 %	0 %	20 %	60 %	384145118
78	NC_017172	CAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145118
79	NC_017172	TTG	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145118
80	NC_017172	GAT	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145118
81	NC_017172	TAC	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145118
82	NC_017172	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145119
83	NC_017172	GTACT	2	10	5223	5232	20 %	40 %	20 %	20 %	384145119
84	NC_017172	AAC	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145119
85	NC_017172	A	6	6	5368	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	384145119
86	NC_017172	TGA	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145120
87	NC_017172	TGC	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
88	NC_017172	GCA	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
89	NC_017172	GAA	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145120
90	NC_017172	CAG	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
91	NC_017172	GAC	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
92	NC_017172	CGC	2	6	5837	5842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
93	NC_017172	CG	3	6	5865	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	384145120
94	NC_017172	CTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
95	NC_017172	GAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145120
96	NC_017172	GCC	2	6	6067	6072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
97	NC_017172	ATC	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145120
98	NC_017172	AGC	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
99	NC_017172	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145120
100	NC_017172	GCTG	2	8	6216	6223	0 %	25 %	50 %	25 %	384145120
101	NC_017172	GCA	3	9	6423	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
102	NC_017172	GCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
103	NC_017172	GCC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
104	NC_017172	AGCCA	2	10	6691	6700	40 %	0 %	20 %	40 %	384145120
105	NC_017172	GCTG	2	8	6720	6727	0 %	25 %	50 %	25 %	384145120
106	NC_017172	GAAA	2	8	6751	6758	75 %	0 %	25 %	0 %	384145120
107	NC_017172	GAT	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145120
108	NC_017172	ACA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145120
109	NC_017172	GC	3	6	6859	6864	0 %	0 %	50 %	50 %	384145120
110	NC_017172	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145120
111	NC_017172	TGGT	2	8	7089	7096	0 %	50 %	50 %	0 %	384145121
112	NC_017172	CTTA	2	8	7103	7110	25 %	50 %	0 %	25 %	384145121
113	NC_017172	TCGG	2	8	7213	7220	0 %	25 %	50 %	25 %	384145121
114	NC_017172	ACT	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145121
115	NC_017172	CAGAA	2	10	7299	7308	60 %	0 %	20 %	20 %	384145121
116	NC_017172	AG	3	6	7311	7316	50 %	0 %	50 %	0 %	384145121
117	NC_017172	TTCC	2	8	7334	7341	0 %	50 %	0 %	50 %	384145121
118	NC_017172	TA	3	6	7711	7716	50 %	50 %	0 %	0 %	384145122
119	NC_017172	GCT	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145122
120	NC_017172	GAT	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145122
121	NC_017172	TCT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145122
122	NC_017172	CAAA	2	8	7895	7902	75 %	0 %	0 %	25 %	384145122
123	NC_017172	AATC	2	8	7919	7926	50 %	25 %	0 %	25 %	384145122
124	NC_017172	CAAT	2	8	7954	7961	50 %	25 %	0 %	25 %	384145122
125	NC_017172	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145122
126	NC_017172	CTT	2	6	8189	8194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145122
127	NC_017172	ATT	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145122
128	NC_017172	T	7	7	8388	8394	0 %	100 %	0 %	0 %	384145122
129	NC_017172	TCTT	2	8	8416	8423	0 %	75 %	0 %	25 %	384145122
130	NC_017172	ACG	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145122
131	NC_017172	GCA	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145122
132	NC_017172	TTG	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145122
133	NC_017172	CAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145122
134	NC_017172	TC	4	8	8657	8664	0 %	50 %	0 %	50 %	384145123
135	NC_017172	TGA	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145123
136	NC_017172	ATA	2	6	8750	8755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145123
137	NC_017172	TCA	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
138	NC_017172	ATATT	2	10	8840	8849	40 %	60 %	0 %	0 %	384145123
139	NC_017172	TGA	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145123
140	NC_017172	T	7	7	8912	8918	0 %	100 %	0 %	0 %	384145123
141	NC_017172	TAT	2	6	9169	9174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145123
142	NC_017172	TCA	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
143	NC_017172	TCT	2	6	9314	9319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145123
144	NC_017172	GTC	2	6	9402	9407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145123
145	NC_017172	T	6	6	9442	9447	0 %	100 %	0 %	0 %	384145123
146	NC_017172	CAG	2	6	9489	9494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145123
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149	NC_017172	ACC	2	6	9586	9591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145123
150	NC_017172	TGGT	2	8	9744	9751	0 %	50 %	50 %	0 %	384145123
151	NC_017172	TTG	2	6	9775	9780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145123
152	NC_017172	GCA	2	6	9791	9796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145123
153	NC_017172	ACT	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
154	NC_017172	TCA	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
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157	NC_017172	GTA	2	6	10574	10579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145124
158	NC_017172	CTG	2	6	10593	10598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145124
159	NC_017172	ATA	2	6	10599	10604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145124
160	NC_017172	AGT	2	6	10771	10776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145124
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162	NC_017172	TTC	2	6	10863	10868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
163	NC_017172	CAA	2	6	10941	10946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145124
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165	NC_017172	CTT	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
166	NC_017172	GCT	2	6	11264	11269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145124
167	NC_017172	TCT	2	6	11305	11310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
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169	NC_017172	TCT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
170	NC_017172	ATC	2	6	11419	11424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145124
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178	NC_017172	TAC	2	6	12670	12675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145126
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183	NC_017172	AT	3	6	12799	12804	50 %	50 %	0 %	0 %	384145126
184	NC_017172	T	6	6	12807	12812	0 %	100 %	0 %	0 %	384145126
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258	NC_017172	CGG	2	6	17306	17311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145130
259	NC_017172	GCC	2	6	17318	17323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145130
260	NC_017172	GAA	2	6	17334	17339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145130
261	NC_017172	GCA	2	6	17433	17438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145130
262	NC_017172	GAC	2	6	17516	17521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145131
263	NC_017172	GGAT	2	8	17560	17567	25 %	25 %	50 %	0 %	384145131
264	NC_017172	AGAA	2	8	17579	17586	75 %	0 %	25 %	0 %	384145131
265	NC_017172	CGG	2	6	17620	17625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145131
266	NC_017172	AGCC	2	8	17709	17716	25 %	0 %	25 %	50 %	384145131
267	NC_017172	ATT	2	6	17885	17890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145132
268	NC_017172	TTC	2	6	17934	17939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145132
269	NC_017172	GC	3	6	17950	17955	0 %	0 %	50 %	50 %	384145132
270	NC_017172	TCT	3	9	17968	17976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145132
271	NC_017172	GCG	2	6	18149	18154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145132
272	NC_017172	TCC	2	6	18223	18228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145132
273	NC_017172	TGGC	2	8	18302	18309	0 %	25 %	50 %	25 %	384145132
274	NC_017172	ATG	2	6	18388	18393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145132
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276	NC_017172	CAA	2	6	18404	18409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145132
277	NC_017172	CT	3	6	18439	18444	0 %	50 %	0 %	50 %	384145132
278	NC_017172	CGC	2	6	18487	18492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145132
279	NC_017172	GTT	2	6	18493	18498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145132
280	NC_017172	TCA	2	6	18499	18504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145132
281	NC_017172	TG	3	6	18542	18547	0 %	50 %	50 %	0 %	384145132
282	NC_017172	GCC	2	6	18555	18560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145132
283	NC_017172	ATG	2	6	18676	18681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145132
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285	NC_017172	GCC	2	6	18842	18847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145133
286	NC_017172	GAG	2	6	18855	18860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145133
287	NC_017172	CCA	3	9	18894	18902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145133
288	NC_017172	AGA	2	6	18974	18979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145133
289	NC_017172	CAC	2	6	18982	18987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145133
290	NC_017172	GTG	2	6	19006	19011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145133
291	NC_017172	GGC	2	6	19050	19055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145133
292	NC_017172	CTC	2	6	19210	19215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145134
293	NC_017172	ACAGA	2	10	19314	19323	60 %	0 %	20 %	20 %	384145134
294	NC_017172	CGGTG	2	10	19348	19357	0 %	20 %	60 %	20 %	384145134
295	NC_017172	AGA	2	6	19427	19432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145134
296	NC_017172	TTG	2	6	19613	19618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145134
297	NC_017172	CTT	2	6	19759	19764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145135
298	NC_017172	AG	3	6	19786	19791	50 %	0 %	50 %	0 %	384145135
299	NC_017172	GAG	2	6	19865	19870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145135
300	NC_017172	TGA	2	6	19873	19878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145135
301	NC_017172	TGCCT	2	10	19891	19900	0 %	40 %	20 %	40 %	384145135
302	NC_017172	ATAGAT	2	12	19928	19939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384145135
303	NC_017172	CAA	2	6	19990	19995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145135
304	NC_017172	CTT	2	6	19999	20004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145135
305	NC_017172	GCA	2	6	20013	20018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145135
306	NC_017172	TAC	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145135
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308	NC_017172	ATG	2	6	20175	20180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145135
309	NC_017172	CTG	2	6	20222	20227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145135
310	NC_017172	TGC	3	9	20239	20247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145135

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.